مطالعه جهش های موجود در اگزون 2 ژن gdf9 گوسفندان آمیخته حاصل تلاقی بین قوچ های نژاد رومانوف و پاکستانی با میش های نژاد کرمانی و نژاد لری بختیاری به روش pcr-sscp

برای کاهش تعداد میش¬های مولد روی مراتع و جلوگیری از تخریب مراتع به نظر می¬رسد که برنامه‏های اصلاح¬نژادی روی ژن¬های با اثر عمده بر چندقلوزایی در نژاد¬های کشور برای شناسایی ژن¬های کاندیدای مژثر بر این صفات اقتصادی لازم باشد. لذا، هدف از انجام این تحقیق شناسایی چندشکلی¬های تک¬نوکلئوتیدی موجود در کل اگزون 2 ژن فاکتور رشد و تمایز 9 (gdf9) در گوسفندان آمیخته حاصل تلاقی بین قوچ¬های نژاد رومانوف و پاکستانی با میش¬های نژاد کرمانی و نژاد لری¬بختیاری به روش pcr-sscp بود. به این منظور، از 338 رأس گوسفند (از 7 نژاد خالص و آمیخته) خونگیری شد. سپس dna استخراج و pcr با استفاده از آغازگرهای طراحی شده برای قطعه¬های 634 و 647 جفت¬بازی صورت گرفت، که با احتساب دو جفت آغازگر طراحی شده برای اگزون 2 ژن gdf9 تعداد نمونه¬های مورد بررسی در این مطالعه به 676 نمونه رسید. پس از به دست آمدن الگوهای باندی روی ژل اکریل¬آمید، از هر الگو یک نمونه توالی¬یابی شد. در جایگاه نیمه اول، پنج snp شناسایی شد که از پنجsnp مشاهده شده سه snp با تغییر اسید آمینه و دو snp بدون تغییر اسیدآمینه همراه بودند. پنج ژنوتیپ و هشت هاپلوتایپ مختلف از این پنج snp در مجموع هفت جمعیت مورد مطالعه حاصل شد. بر اساس شاخص شانون بیشترین تنوع ژنتیکی به ترتیب در جمعیت¬ آمیخته¬های کرمانی و رومانوف و آمیخته¬های لری-بختیاری و رومانوف مشاهده شد و بر اساس شاخص نئی بیشترین فاصله ژنتیکی بین دو جمعیت پاکستانی و لری¬بختیاری و کمترین فاصله ژنتیکی بین دو جمعیت لری¬بختیاری و آمیخته¬های لری¬بختیاری و پاکستانی مشاهده شد. در جایگاه نیمه دوم، پنج snp شناسایی شد که از پنجsnp مشاهده شده سه snpبا تغییر اسید آمینه و دو snp بدون تغییر اسیدآمینه همراه بودند. شش ژنوتیپ و هفت هاپلوتایپ مختلف از این پنج snp در مجموع هفت جمعیت مورد مطالعه حاصل شد. بیشترین تنوع ژنتیکی به ترتیب در جمعیت¬ آمیخته¬های کرمانی و رومانوف و آمیخته¬های لری¬بختیاری و رومانوف مشاهده شد. بیشترین فاصله ژنتیکی بین دو جمعیت آمیخته¬های کرمانی و رومانوف با آمیخته¬های کرمانی و پاکستانی و همچنین کمترین فاصله ژنتیکی بین دو جمعیت آمیخته¬های لری¬بختیاری و رومانوف با آمیخته¬های کرمانی و رومانوف مشاهده شد. در مجموع از ده snp شناسایی شده در کل اگزون 2 ژن gdf9 در این مطالعه، چهار snp تاکنون در هیچ مطالعه¬ای شناسایی نشده بود.